CEMS鍋爐煙氣連續自動監測系統是由多個環節構成的，因此系統中無論哪個環節出現問題都會直接影響整個系統的正常可靠運行。以下對在線監測維護做簡單介紹。

（一）儀器零部件的維護

    監測儀器在長時間連續運行過程中隨著時間的推移，電路、光路和氣路等的電子元器件變化、老化必然會產生各種各樣的問題和故障。應不定期檢測儀器各項性能，并用標準氣體進行定期校準，對漂移嚴重者要更換相關儀器組件。有些省市環保部門針對儀器元件的使用壽命規定在線監測儀器凡超過六年需整體更換。

（二）外界條件對分析儀器的影響

    例如，供電質量的波動和臨時停電容易造成儀器內部元件因樣品的瞬間停留而損壞；在線監測機房的溫度應在儀器要求的范圍內，以免因溫度過高而燒壞儀器；同時操作人員和維護人員的技術素質差異也都會直接影響監測數據的準確性。所以必須對包括中心站和子站在內的整個系統進行全面維護，才能確保連續自動監測系統正常運行。

（三）樣品預處理裝置的維護

    在線分析儀器無論如何復雜和精確，樣品進入分析測定系統前都需要適當的預處理，系統中的樣品預處理裝置是否處于良好狀態是保證監測數據可靠精準的關鍵，因此是維護中的重點。例如，水質在線監測中應定期清洗濾網，以免水樣中含有的懸浮物導致監測結果偏大，嚴重時導致管路堵塞；煙氣在線監測中，風機濾網、一級過濾器、二級過濾器等應定期更換，以免管路堵塞或過濾器失去作用后對分析監測結果造成影響。